CRISPR/Cas9是一种能够对基因组的特定位点进行精确编辑的技术。其原理是核酸内切酶Cas9蛋白通过导向性RNA(guide RNA,gRNA)识别特定基因组位点并对双链DNA进行切割,细胞随之利用非同源末端连接(Non homologous End Joining,NHEJ)或者同源重组(Homologous Recombination,HR)方式对切割位点进行修复,实现DNA水平基因敲除或精确编辑。
1、CRISPR基因敲除:利用CRISPR/Cas9技术进行单基因或多基因敲除。其核心组成部分包括:
(1)单链向导RNA(single-guide RNA,sgRNA):负责识别靶基因DNA序列。
(2)具有核酸内切酶活性的Cas9蛋白:负责切割DNA。
CRISPR/Cas9系统通过sgRNA识别靶基因DNA,并引导Cas9核酸内切酶对DNA进行剪切。基因组发生双链断裂后,细胞通过NHEJ机制进行修复,此过程通常会随机引入若干碱基的插入或缺失。若插入或缺失的碱基数非3的倍数,就会导致阅读框移位,从而造成基因功能失活,实现基因敲除。
图1 CRISPR / Cas9 KO原理
2、CRISPR过表达:利用CRISPR/Cas9进行单基因过表达。
通过修饰CRISPR/Cas9系统中的一些元件,形成一种蛋白复合物-协同激活介质(SAM),可实现对多数细胞内源基因的特异性激活。该系统灵活方便,为研究基因功能提供了极为便利的工具。
CRISPR-SAM系统由三部分组成:
(1)失去核酸酶活性的dCas9 (deactivated Cas9) -VP64融合蛋白。
(2)含2个MS2 RNA adapter的sgRNA。
(3)MS2-P65-HSF1激活辅助蛋白。
CRISPR-SAM系统中的MS2-P65-HSF1激活辅助蛋白就是SAM,全称为SynergisticActivation Mediator(协同激活调节器),这也就是CRISPR-SAM的命名由来。CRISPR-SAM借助dCas9-sgRNA的识别能力,通过MS2与MS2adapter的结合作用,将P65/HSF1/VP64等(均为转录激活因子)拉拢到目的基因启动子区域,成为一种强效的选择性基因活化剂,从而增强基因的转录表达。
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