shRNA(short hairpin RNA,短发夹RNA)是一种通过RNA干扰(RNAi)机制实现基因特异性沉默的有效工具。shRNA分子包含两个短反向重复序列,中间由一个茎环(loop)序列分隔,形成发夹结构。当克隆到表达载体中时,shRNA通常由pol Ⅲ启动子控制转录,并在末端连接5-6个T作为RNA聚合酶Ⅲ的转录终止子。
在细胞内,shRNA转录产物经过Dicer酶加工后形成siRNA,随后与RISC复合物结合,特异性识别并降解靶mRNA分子,从而抑制目标基因的表达。这种技术为基因功能研究、信号通路分析和基因治疗开发提供了强有力的工具。
1、确定靶基因信息:根据客户提供基因的NCBI号或序列确保所选靶点序列的特异性。
2、设计合成shRNA:基于靶基因序列设计特异性shRNA序列并合成。
3、构建载体:将设计好的shRNA序列构建到载体中,并转化至感受态细胞,并通过抗生素筛选阳性克隆。
4、测序验证:从阳性克隆中提取质粒后,进行测序验证,确保shRNA序列正确插入且无突变。
5、扩增:对经过验证的正确克隆进行扩增提取。
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