10x Genomics 单细胞ATAC-seq
在解决细胞异质性的同时，研究表观遗传学调控机制
同时结合motif分析来识别参与基因表达调控的转录因子
是单细胞表观遗传学的重要突破
单细胞基因组染色质可接近性分析
10x Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution（10x scATAC-seq）是在单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单细胞染色质可接近性图谱构建，不仅能清晰了解染色质结构，还可以绘制高分辨率转录因子调控网络，为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。
技术原理
样本准备：
（1）细胞类型：细胞系，PBMC，新鲜组织；
（2）细胞来源：血液提取、磁珠富集、流式分选、组织解离；
（3）细胞大小：直径<40 μm；
（4）细胞浓度：5×105~1.2×106/ml；
（5）细胞活性：>90%；
（6）细胞数目：≥ 1×105 cells/sample。
（7）保存运输：建议选择上门服务，减少风险！！
数据分析：
应用案例：
研究人员通过单细胞ATAC-Seq的研究策略，分析了10类已定义的人类造血系统分化细胞类型中染色质可接近性的数据，构建造血细胞分化中染色质可接近性状态的变化轨迹；并整合单细胞转录组数据，构建了转录因子动态调控轨迹。
从单细胞RNA-seq和ATAC-seq的整合分析提供了对人类造血功能的调节特征和动态的见解，在实验或计算上整合多种单细胞数据类型的进一步改进将为发育或疾病细胞命运决策提供单细胞水平上的视角。期望未来的工作结合单细胞表观基因组学、转录组学、蛋白质组学和谱系测量可以揭示对启动调节多种细胞命运转换的调节因子的分子机制和时间顺序的重要见解。
